中国种业 发表于 2014-4-3 20:40:47

揭穿一个忽悠人的错误标准(4)

作者:张世煌

   四、延伸讨论1--双盲检测是基本要求

   “双盲法”是基本要求,也是国际上普遍接受的操作方法。采用双盲法,既保护了操作者与主管部门,也充分保证了结果的公正性。操作者与主管部门杜绝了“人情操作”的可能性。同时,这也是技术能力自信与过硬的标志。以往因为有关系网笼罩,所以躲开专家论证,然后堂而皇之地通过违规操作而公然行骗。这关系到管理部门公权力的威信,建议管理部门招标更有资质的实验室承担此项业务。(顺便说明,北京某赵氏实验室的收费标准是实际成本的20-40倍。如果与最新技术比较,他们的收费标准超过成本数千倍。独家垄断就造成这个后果。建议施行收支两条线,严格规章制度,防控垄断和腐败。)

   建议委托少数几家先进的实验室研制基于SNP芯片或重测序数据库的双盲检测方法,关键是建立一个数据库雏形和导入生物信息管理技术。华大、中国农科院、中国农大和吉林农科院均有资质做这项Pilot研究。(大北农应该是最有这方面能力的,但他们是企业,不宜承担数据库建设,但应听取他们的论证意见和建议。)

   在做双盲检测时,玉米基因组数据库是有用的。

   企业开展分子标记辅助育种,作为基础性工作,需要对现有自交系重测序。两年前美国研制了1000K(百万级)的玉米基因组芯片,提升了研发能力。对自交系重测序,建数据库,这是标记辅助育种的基础性工作,将来有实力的企业都需要。但我国种业还比较落后,目前没有实力,也没有需求建立这样的数据库,暂时要国家设立分子标记辅助育种平台,建立公共数据库的雏形,作为鼓励商业育种的Pilot项目。既然是Pilot项目,就只是一个点,而不是面,因此它的作用有限。当企业有实力进行分子育种,可以在公共数据库的基础上充实专有信息,把原本用处不大的公共数据库变成商业育种必不可少的专有数据库。这样的数据库既有育种价值,也具有类似DUS检测工具的分子生物学意义。但那是企业的商业机密。而低端的赵氏数据库早已经没用。

   就品种保护来说,做双盲检测时需要分子指纹数据库。从市场上或品种区域试验中筛查侵权事件,不可能一对一检测,因为不知道潜在的侵权目标,于是需要依靠重测序形成的数据库作双盲检测;不是杂交种,而是已有自交系数据库。依照那个忽悠人的标准至今做不到双盲检测。这一直是他们的短板。十年前(2002年),我们提出对自交系制作SSR等位基因阶梯数据库。这项技术不复杂,但某赵实验室至今没有掌握生物信息管理的核心技术。事过境迁,SNP芯片技术已经成熟和简化,能够在双盲条件下捕捉到有用的信息和证据。前面说的那些SSR技术已经过时,但双盲检测可以借用商业育种建立的自交系SNP数据库。这与分子育种的基础性工作重合,所以,今后审理侵权案件时,举证责任在企业。为了防止在检测DNA过程里种质资源流失和确保数据准确,种子公司可自行检测,或委托华大等有资质的独立机构检测,然后提交数据,如果有造假,由当事者承担责任。(注释:SSR技术作为单向检测仍可继续使用,在一对一的限定情况下,可以证伪,却不能证同一。管理者和操作者都要明确,它的适用范围有限,做不到双盲,不可滥用。)

   当积累很多自交系重测序信息时,可以对市场上的杂交种进行扫描,即使不知道杂交种的系谱,也能够判断出是否使用了某个已知自交系,以及使用到什么程度,甚至判断其中某个亲本自交系的亲本来源。前提条件是必须把现有自交系都收入数据库。这就出来一个商业机密问题。于是,将来只有企业才可以进行这类分析和举证,但他们只可以保护自己的知识产权,而不知道其他公司的信息。政府机构的职责是制定相对稳定的方法指南。在芯片技术普及的条件下,这不难做到。

   有了数据库,在特定条件下,可以从大量杂交组合中鉴定隐含的亲本或某亲本的亲本来源。但这需要企业自建数据库,并对专有自交系进行保护。分子标记辅助育种需要对现有自交系做重测序,积累数据。这些属于商业育种的基础性工作,将来有实力的企业都需要。但这类数据库恐怕不是赵氏课题组能够做下来的。

   北京某赵氏制作的世界上“最大”的数据库,将来可不可以移交给企业接着往下做呢?现在就要说明白,没用的东西不值得延续。他们那个粗制滥造的世界上最大的数据库,除了哗众取宠和招摇撞骗,在企业的分子育种过程里已经没有用处。将来企业要开展标记辅助育种,或仅仅是出于品种保护的目的,建议委托华大公司,或者设法从谢传晓博士、赖锦盛教授获得基于SNP芯片的共性技术和公共数据库,然后向分子育种延伸。

   赵久然经常发明一些错误概念以哗众取宠,却损害了中国的种子产业,最直接的损害就是用“超级”概念陷某种业公司于困境。还提出过一些其他似是而非的概念流传甚广,已经难以纠正……而他所提出来的“真实性”概念和两个SSR位点差异标准更加有害,为大规模剽窃育种奠定了法理基础。我们等着瞧,今后怎么纠正这个错误!

   中国农业科技界(不单玉米界),现在一个很重要的问题是科学家用科学的方法造假。在文革和文革以前的浮夸年代,造假不讲技术,不讲科学,这类假很容易被识破。现在用科学方法造假,这个假很难被识破,对未来的影响远比不讲科学的造假严重得多,深远得多。(待续)

   (技术发展真是快,在我把这篇文稿分段上载博客时,更新的技术已经趋于成熟,而且价格相当便宜。北京某赵氏检测一个样本要6000人民币,SNP芯片技术检测一个样本100美元,而GBS只要100人民币。关键不在技术的先进程度和成本价格,而在于思路对不对,这是关键。)
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